因为使用的Ubuntu 长久没有使用，使用下载的时候突然报错，使用ssh key这种方式进行clone ，pull github上面的项目，使用 git clone或者git pull origin master出现permission denied (publickey)，原因是因为ssh key过期失效或者没有ssh key。 显示如下错误:

Permission denied (publickey) 没有权限的publickey ，这个错误的原因一般是两个
1.客户端与服务端未生成 ssh key
2.客户端与服务端的ssh key不匹配
找到问题的原因了，解决办法也就有了，重新生成一次ssh key,然后将这个ssh key添加到github账户上面 即可。

按照如下步骤进行重新生成:

1.检查SSH key是否已经存在

用这个命令 ls ~/.ssh/
进行检查 id_rsa.pub 是否存在，如果存在，就不用生成一个新的SSH key了，直接跳到下面的第3步。

2.如果第1步中的SSH key不存在，生成一个新的SSH key
命令如下，其中，your_email@example.com要修改成你的邮箱地址。

ssh-keygen -t rsa -b 2048 -C “your_email@example.com”

回车后输出如下：

Generating public/private rsa key pair.
Enter file in which to save the key (/home/xxx/.ssh/id_rsa):

其中，xxx是你的用户名，直接回车，会将key保存到默认文件中。
接着会输出：

Enter passphrase (empty for no passphrase):
Enter same passphrase again:

这两步是让你输入一个密码，以及确认密码，这个密码在你提交代码到Github时会用到【注意：记住这个密码，最简单的方式就是设置的和github账户登入密码一样，容易记住】
回车后就提示成功了：
Your identification has been saved in /home/xxx/.ssh/id_rsa.
Your public key has been saved in /home/xxx/.ssh/id_rsa.pub.
The key fingerprint is:
01:0f:f4:3b:ca:85:d6:17:a1:7d:f0:68:9d:f0:a2:db your_email@example.com
到这一步，你会发现 ~/.ssh/id_rsa.pub 文件已经生成了。
（3）将SSH key添加到ssh-agent
先确认ssh-agent处于启用状态：

ssh-agent -s

输出类似于：

然后将SSH key添加到ssh-agent（此处如果出现could not open a connection to your authentication agent 参考此处步骤4）：

ssh-add ~/.ssh/id_rsa

这时又会要你输入密码：

Enter passphrase for /home/xxx/.ssh/id_rsa:

输入刚才记起来的密码，然后回车

（4）将SSH key添加到Github账户中
直接在打开id_rsa.pub这个文件（这就是我们刚刚生成的ssh key文件），

gedit .ssh/id_rsa.pub

打开github.com，登入账户，点击头像旁边的下拉按钮，选择settings —- 。如下图：

选择ssh and gpg keys —— new ssh key —- 粘贴 —- 保存

（5）保存后，就能看到建立的ssh key，git 客户端就能够正常使用了

使用ssh测试链接。

ssh -T git@github.com

提示：如下信息就OK了。会发现，出现下面的情况 不用担心没什么影响，这句话其实一直存在，它只是想告诉你，github 不允许 shell 交互。仅此而已。

现在整个git 就能正常的下载和使用了。
感谢下面作者的参考：
permission denied (publickey)问题的解决 和 向github添加ssh key

解决git@github.com: Permission denied (publickey)

解决You‘ve successfully authenticated, but GitHub does not provide shell access.

解决git@github.com: Permission denied (publickey). fatal: Could not read from remote repository.