如何使用 Python 读取数据量庞大的 excel 文件
通过上述几种方法,可以大幅优化使用 Python 读取大型 Excel 文件的性能。openpyxl适用于灵活处理.xlsx文件,pyxlsb则是处理.xlsb文件的利器,而使用dask可以分块读取并行处理大数据集。此外,如果可以转换文件格式,使用.csv是提升读取速度的有效途径。不同的方案适用于不同的场景,开发者可以根据具体需求选择最合适的解决方案。例如,当文件格式无法改变时,openpyxl结
使用 pandas.read_excel
读取大文件时,的确会遇到性能瓶颈,特别是对于10万行20列这种规模的 .xlsx
文件,常规的 pandas
方法可能会比较慢。
要提高读取速度,关键是找到更高效的方式处理 Excel 文件,特别是在 Python 的生态圈中,已经有多个技术可以帮助解决这个问题。
一种办法是使用 openpyxl
直接处理 Excel 文件,结合 pandas
来读取数据。这可以让我们在处理数据时获得更大的灵活性,并通过分块读取文件来提高效率。
官网地址:
https://openpyxl.readthedocs.io/en/stable/
另外,还可以选择 pyxlsb
这个库,它可以更快速地处理 .xlsb
格式的文件,比传统的 .xlsx
格式快很多。
官网地址:https://pypi.org/project/pyxlsb/
如果可能的话,将文件转为 .csv
格式读取也会显著提高性能,因为 CSV 文件是纯文本格式,相较于 .xlsx
的结构化存储,读取会更加高效。
分析 pandas.read_excel
的性能问题
在实际中,pandas.read_excel
本身的性能瓶颈主要来自于两个方面:数据的解析与文件的格式。.xlsx
是一种基于 XML 的文件格式,因此在读取时需要解析 XML,这本身就是一个比较慢的过程。尤其当文件较大时,解析 XML 的时间会大幅增加。
为了解决这个问题,可以考虑以下几种优化策略:
-
使用不同的引擎:
pandas
支持多种 Excel 解析引擎,比如openpyxl
和xlrd
。根据情况选择合适的引擎,可能会改善读取性能。 -
分块读取:可以通过逐步读取文件的方式,避免一次性将整个文件加载到内存中。这可以显著减少内存占用,并提高读取的稳定性。
-
选择合适的文件格式:如果文件格式不是必须的,可以将
.xlsx
文件转为.csv
文件,这样可以使用更高效的读取方法。
优化方案 1:使用 openpyxl
和 pandas
openpyxl
是 pandas
内置支持的引擎之一,但它的读取速度较慢。在这种情况下,可以手动使用 openpyxl
读取数据,然后将其转换为 pandas
的 DataFrame
。
代码示例
import pandas as pd
from openpyxl import load_workbook
# 读取xlsx文件的路径
file_path = "your_large_file.xlsx"
# 使用 openpyxl 直接加载工作簿
wb = load_workbook(filename=file_path, read_only=True)
sheet = wb.active
# 使用生成器按行读取数据,避免一次性加载所有数据
data = []
for row in sheet.iter_rows(values_only=True):
data.append(row)
# 转换为 pandas DataFrame
df = pd.DataFrame(data[1:], columns=data[0])
# 打印读取的数据
print(df.head())
通过这种方法,我们避免了一次性将整个文件加载到内存中,而是使用了 openpyxl
的 iter_rows
方法逐行读取文件内容。这样,即使文件非常大,也能有效减轻内存负担。
优化方案 2:使用 pyxlsb
读取 .xlsb
文件
.xlsb
是二进制的 Excel 文件格式,它比 .xlsx
文件格式更为高效,尤其是在处理大文件时,可以显著减少读取时间。pyxlsb
库是一个专门用于读取 .xlsb
文件的高效库,配合 pandas
可以更快地读取数据。
代码示例
import pandas as pd
from pyxlsb import open_workbook
# 将 .xlsx 文件转换为 .xlsb 格式后使用此方法读取
file_path = "your_large_file.xlsb"
with open_workbook(file_path) as wb:
with wb.get_sheet(1) as sheet:
data = []
for row in sheet.rows():
data.append([item.v for item in row])
df = pd.DataFrame(data[1:], columns=data[0])
print(df.head())
使用 pyxlsb
可以有效加快 Excel 文件的读取速度,特别是在处理非常大的文件时,这个方法比 pandas.read_excel
提供的默认引擎快很多。不过需要注意的是,这种方法仅适用于 .xlsb
格式文件。
优化方案 3:使用 dask
分块处理大数据
dask
是一个支持并行计算的 Python 库,它可以用来处理大型数据集。如果我们遇到的数据文件过大,dask
提供了类似 pandas
的 API,但它会将大文件分块处理,避免一次性占用大量内存。
代码示例
import dask.dataframe as dd
# 使用 dask 读取大文件
file_path = "your_large_file.xlsx"
df = dd.read_excel(file_path)
# 使用 dask 处理数据
print(df.head())
dask
是一个非常强大的工具,它不仅支持分布式计算,还可以在多核环境下加快处理速度。通过将文件拆分成小块并行处理,dask
能够高效地应对大规模数据集的读取和计算。
优化方案 4:将文件转换为 CSV 格式
如果文件的格式不是必须的,那么将 .xlsx
文件转换为 .csv
格式是一种直接且有效的方式。.csv
格式相较于 .xlsx
没有复杂的 XML 结构,因此读取速度会快得多。转换后可以直接使用 pandas.read_csv
来读取数据,速度会比 read_excel
快很多。
代码示例
import pandas as pd
# 假设已经将文件转换为 CSV 格式
file_path = "your_large_file.csv"
# 使用 pandas 读取 CSV 文件
df = pd.read_csv(file_path)
# 打印前几行数据
print(df.head())
通过这种方式,能够显著提高数据读取速度,因为 .csv
格式的文件是纯文本,不需要复杂的解析过程。
其他可能的优化策略
除了前面提到的几种方法,还有一些其他技术可以用来进一步优化 Excel 文件的读取速度:
-
并行读取:如果系统支持,可以将 Excel 文件按工作表或其他分块标准进行拆分,使用并行处理技术(如
multiprocessing
)同时读取多个小文件。 -
数据格式优化:如果文件的数据结构允许,转换为 Parquet 或 HDF5 格式,这些格式在大数据处理方面的性能往往优于 Excel 和 CSV。
-
增加内存或硬件支持:在某些极端情况下,硬件资源不足也可能是瓶颈。增加内存或使用更快的硬盘(如 SSD)可以提高整体数据读取的性能。
总结
通过上述几种方法,可以大幅优化使用 Python 读取大型 Excel 文件的性能。openpyxl
适用于灵活处理 .xlsx
文件,pyxlsb
则是处理 .xlsb
文件的利器,而使用 dask
可以分块读取并行处理大数据集。此外,如果可以转换文件格式,使用 .csv
是提升读取速度的有效途径。
不同的方案适用于不同的场景,开发者可以根据具体需求选择最合适的解决方案。例如,当文件格式无法改变时,openpyxl
结合 pandas
是一个相对平衡的选择,而在文件格式灵活的情况下,将 .xlsx
转为 .csv
并使用 pandas.read_csv
则能最大化提高读取性能。
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