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为了方便各位更快的找到自己所需要的科研软件，因此我做了一个往期软件目录，点击蓝色字体即可链接对应文章！

软件名称	主要功能
HighScore3.0.5+	XRD数据分析工具
Thermo Avantage	XPS数据分析工具
MDI Jade 6.5	XRD数据分析
LabSpec	拉曼光谱分析
MestReNova 14‍	核磁共振NMR数据处理
Image J	科研图像处理工具
CasaXPS	XPS数据分析‍
RasMol 2.7.5.2	观察生物分子微观结构
Nano Measurer 1.2.5‍	纳米颗粒粒度分析软件
Diamond‍	原子水平晶体结构可视化
Endnote‍	文献管理软件
Origin‍	数据分析工具
3Dsmax‍	三维建模和渲染软件
DigitalMicrograph3.5‍	电镜图像分析软件
CrystalMaker‍	晶体分子结构图绘制软件
Peakfit	非线性拟合软件‍
olex2	晶体结构解析软件
Outotec HSC Chemistry‍	热化学分析软件
omnic‍	红外数据分析软件
AutoCAD	科研绘图软件
Materials Studio	分子材料计算模拟软件
Multipak	XPS和AES数据分析软件
Xcalibur‍	质谱数据分析软件
Mercury	观察晶体结构软件
Nanoscope Analysis	AFM数据处理软件
Image Pro Plus	图像分析软件
ZSimpWin	阻抗谱拟合软件
Masshunter	质谱采集分析软件
Cytoscape	生物信息分析软件

 目录

1. 软件下载

2. 软件介绍

3. 安装教程

4. 使用教程

软件下载

[软件名称]：CrysTBox

[安装环境]：Win11/Win10/Win9/Win8/Win7

[系统位数]：64位

[软件类型]：TEM数据分析软件

[下载链接]：公众号回复【CrysTBox】

软件资源链接及软件解压密码

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回复【CrysTBox】获取

（ps: 复制括号内红色的关键词回复，不要手动输入，如空格或字母大小写会影响关键词的软件推送）

软件介绍

CrysTBox是一款TEM数据分析软件，它可以自动标定TEM衍射斑点，可特别用于使用衍射或高分辨率TEM（HRTEM）图像进行自动晶轴确定，测量衍射光斑之间的距离和角度，并将相应晶面的索引自动分配给该光斑。整个过程不受轻微校准误差的影响。

安装教程

注意事项

①解压安装包和软件安装时，关闭杀毒软件，否则安装文件容易被误删除；

②安装软件时，要右击压缩包，把压缩包解压出来，不要直接双击压缩包；

③安装包及软件安装路径，最好是英文或数字，如有中文路径，容易报错；

1.下载安装包，并解压安装包

2.打开解压后的文件夹，鼠标右击“CrysTBox64-mcr”，选择【以管理员身份运行】。

3.点击“下一步”

4.安装位置：把 C 直接改成 D，或者点击“浏览”自己选择安装位置，勾选“将快捷方式添加到桌面”最后点击“下一步”

5.安装位置：把 C 直接改成 D，或者点击“浏览”自己选择安装位置，最后点击“下一步”

6.点击"是"

8.点击“是”，点击“下一步”

9.点击“安装”

10.正在安装

11.点击“完成”

12.双击桌面软件图标，打开软件，界面如下

使用教程

打开CrysTBox:diffractGUI，我们看到用户界面包括以下几个区域（参见图1）。

图1. CrysTBox:diffractGUI的用户界面

其中：

（a）输入图像细节；

（b）在输入图像中可视化部分和最终结果；

（c）启动整个分析的按钮；

（d）按钮启动分析和基本设置的各个步骤；

（e）RANSAC找到的晶格参数；

（f）理论晶面间距(底部）和实验晶面间距之间的比较（顶部）；

（g）带有可能解决方案的弹出菜单；

（h）校准系数;

（i）所选解决方案的参数。

（1）首先需输入样品晶胞的信息。步骤：点击Material旁的下拉菜单，找到相应的晶胞信息。如果找不到，可以通过File…选项导入。此外，可以参考免费的晶胞数据库，网址：https://materialsproject.org/。

图2. 选择或添加晶胞信息

（2）除了晶胞信息，还需要导入图像。可接受的图像类型包括选区电子衍射（SAED）、纳米束电子衍射（nanobeam diffraction）或会聚束电子衍射（CBED）图案，也可以使用HRTEM图像，因为该工具会自动通过快速傅里叶变换将其转换成倒易空间。步骤是：点击Browse，然后选择相应的衍射图。

（3）图像需进行简单处理。需要校准图像的比例尺。你可以直接在resolution后填写，或者从图片中校准比例尺。若选择后者，步骤是：点击Tools，然后选择Manual image calibration，如图3所示。

图3. 手动图像校准

（4）接着打开一个新界面（见图4），使用鼠标滚轮放大图片，绘制标尺（蓝色线段），在左下方输入相应的比例尺数值（例如10 1/nm），然后点击done。

图4. 图像校准页面

（5）当斑点相对较小时，可能影响识别过程，此时可以裁剪图片（见图5）。步骤：点击Image，选择adjust，然后选择crop。

图5. 图像剪切

（6）接下来是程序运行前的页面（见图6），以SnS硫化锡为例，其resolution数据通过图像校准自动获得，晶胞数据则来源于materials project网站下载。

图6. 前期准备工作完毕

（7）启动程序运算，点击Launch all即可运行至完成，或逐步点击Detect beams并寻找30个数据点。运算后的界面如图7所示，我们可以通过Zone ax.了解晶轴方向，并且通过Rating得知数据匹配结果为Excellent，从而确认这是[001]晶轴。左图显示每个点对应的晶面指数。

图7. 运算后界面

（8）点击Choose vectors按钮，可以看到最靠近原点的几个晶面数据（见图8），由此获取其夹角，并通过D-spacing区域获得每个晶面间距的结果。

图8. 离原点最近的几个晶面数据

5. 可能遇到的问题

（1）若导入的图片不够清晰或衍射斑点不够明显，程序可能无法继续。可选择adjust candidates manually，手动选择约30个点，软件将自动匹配。

（2）如果Rating结果不理想，比如低于good，建议手动选择数据点。

（3）在Zone ax.结果中可能会有多个选项。首先可能等效，或者因图像质量或拍摄时未正对晶轴所致。可观察Rating结果，不同晶轴的Rating可能不同，并结合结果判断最接近的晶轴。

以下是相关生物软件的往期文章，可点击查看！

往期资源汇总部分贴

1.全网最全！RasMol 2.7.5.2 WIN版本，观看生物分子3D微观立体结构！软件安装包下载 安装教程步骤,以及使用教程！

2.全网最全！质谱数据分析软件Xcalibur安装教程（附安装包），以及使用教程！

3.全网最全！图像分析软件Image-Pro Plus安装教程（附安装包），以及免疫组化分析教程！

4.全网最全！质谱采集分析软件Masshunter安装教程（附安装包），以及使用教程！

温馨提示：分享的所有软件，均由互联网中的资源整理所得，仅限学习交流，切勿商用，侵删！

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