本节书摘来自华章计算机《数据科学:R语言实现》一书中的第3章,第3.12节,作者 丘祐玮(David Chiu),更多章节内容可以访问云栖社区“华章计算机”公众号查看。

3.12 估计缺失数据

之前的教程介绍了如何检测数据集中的缺失数值。尽管包含缺失值的数据并不完整,但是我们还是要采用启发式的方法来补全数据集。这里,我们会介绍一些技术来估计缺失值。

准备工作

按照3.3节“转换数据类型”教程,把导入数据的每个属性转换成合适的数据类型。同时按照3.2节“重命名数据变量”中的步骤,命名employees和salaries数据集的列名。

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实现步骤

执行下列步骤,估计缺失值。

1.首先,我们设置emp_no为10001,抽取用户数据子集。
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2.然后,我们故意把第8行的salary设置为缺失值:
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3.第一个估计方法是,我们可以使用函数na.omit移除带有缺失值的记录:
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4.另外,我们可以计算雇员10001的平均薪水:
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5.然后,我们可以使用雇员10001的平均薪水来估计缺失值:
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6.除了上述方法,我们可以使用mice程序包来估计数据:
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7.下列步骤可以让我们使用函数mice来估计数据:
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运行原理

估计缺失值的方法通常有3种:第1个是移除缺失值,第2个是执行平均值估计,最后一个是执行多重估计。在本教程中,我们使用了一个雇员的数据作为例子。首先我们设置emp_no为10001,抽取数据子集。然后我们专门把某个薪水值替换为NA缺失值。接着,我们使用其中一种估计方法进行缺失值估计。

首先,我们介绍了如何使用函数na.omit移除缺失值,它会自动地移除带有缺失值的记录。移除缺失值是直接而简单的做法,并且适合缺失值所占的比例很小的时候。相反,如果缺失值在数据集中占的比重较大,移除这些缺失值会使分析结果产生偏差,并导致错误结论。

其次,我们使用平均值来估计缺失值。我们首先使用函数mean,同时忽略缺失值(na.rm表明计算过程不会考虑缺失值),计算平均薪水。这种估计不会影响平均值的整体估计,但是可能会引起数据集标准差和平方误差的偏差,并进一步导致偏差估计。因此,这并不是一个值得推荐的方法。

第三,我们可以使用函数mice执行多重估计。这里我们首先安装加载mice程序包给R进程,然后从from_date和to_date属性中抽取整数年份。然后,考虑到雇员薪水每年都会增加,我们可以选择贝叶斯线性回归作为估计方法(通过给meth参数设置norm实现)来预测缺失值。最后我们使用函数complete获取完整数据。多重估计方法使用数据之间的关系来预测缺失值,并使用蒙特卡洛方法生成可能的缺失值。这是众多缺失值估计问题中最常见的手段。

更多技能

除了使用mice程序包预测数据集中的缺失值,我们还可以使用回归的方法来预测缺失值。

1.首先,保证test.emp的每一个属性都易于访问:
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2.然后,拟合salary和from_date的回归曲线:
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3.最后,我们可以预测缺失值的薪水值:
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函数lm会生成一个salary对from_date的拟合回归曲线,我们可以使用这个拟合模型来预测1993年的可能薪水值。

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